Protein–RNA interactions for Protein: Q93050

ATP6V0A1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A1Q93050 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP6V0A1Q93050 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V0A1Q93050 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms