Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAD50Q92878 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD50Q92878 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms