Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDAQ92838 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDAQ92838 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDAQ92838 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDAQ92838 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDAQ92838 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDAQ92838 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDAQ92838 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EDAQ92838 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDAQ92838 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDAQ92838 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDAQ92838 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDAQ92838 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDAQ92838 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDAQ92838 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDAQ92838 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDAQ92838 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDAQ92838 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDAQ92838 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDAQ92838 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDAQ92838 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EDAQ92838 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDAQ92838 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDAQ92838 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms