Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX38Q92620 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHX38Q92620 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms