Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS9Q8WXC6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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COPS9Q8WXC6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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COPS9Q8WXC6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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