Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY2Q8WXA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY2Q8WXA3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY2Q8WXA3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms