Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF31Q8WWY3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRPF31Q8WWY3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF31Q8WWY3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms