Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBLCP1Q8WVY7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms