Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC12Q8WUD4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC12Q8WUD4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms