Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3IP1Q8TDR0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms