Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCOLN3Q8TDD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCOLN3Q8TDD5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms