Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF398Q8TD17 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms