Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms