Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HJURPQ8NCD3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms