Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPC24Q8NBT2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPC24Q8NBT2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms