Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB91

FANCB, Fanconi anemia group B protein, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCBQ8NB91 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCBQ8NB91 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCBQ8NB91 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCBQ8NB91 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCBQ8NB91 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCBQ8NB91 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCBQ8NB91 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCBQ8NB91 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCBQ8NB91 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms