Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNLDC1Q8NA58 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms