Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF3Q8N9W5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms