Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD53Q8N9V6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms