Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms