Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTLL6Q8N841 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL6Q8N841 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL6Q8N841 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms