Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00469Q8N7U9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00469Q8N7U9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms