Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00612Q8N6U2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00612Q8N6U2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms