Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HDDC3Q8N4P3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDDC3Q8N4P3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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