Protein–RNA interactions for Protein: Q8N414

PGBD5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD5Q8N414 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD5Q8N414 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGBD5Q8N414 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGBD5Q8N414 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms