Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCE1Q8N0S2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCE1Q8N0S2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE1Q8N0S2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms