Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACE1Q8IYU2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HACE1Q8IYU2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms