Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPAP2Q8IXW5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms