Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLF2Q8IX21 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLF2Q8IX21 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms