Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC9A9Q8IVB4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A9Q8IVB4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms