Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM139Q8IV31 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM139Q8IV31 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms