Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM50Q86XT4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM50Q86XT4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM50Q86XT4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms