Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASSF3Q86WH2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASSF3Q86WH2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms