Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP1Q7Z6B7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP1Q7Z6B7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP1Q7Z6B7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP1Q7Z6B7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP1Q7Z6B7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP1Q7Z6B7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP1Q7Z6B7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRGAP1Q7Z6B7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRGAP1Q7Z6B7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms