Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKD1L3Q7Z443 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PKD1L3Q7Z443 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD1L3Q7Z443 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms