Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT25Q7Z3Z0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT25Q7Z3Z0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms