Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF23Q7RTU1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF23Q7RTU1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF23Q7RTU1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF23Q7RTU1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF23Q7RTU1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF23Q7RTU1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF23Q7RTU1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms