Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SV2AQ7L0J3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms