Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUFY3Q7L099 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUFY3Q7L099 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms