Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZRN4Q6ZMN7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZRN4Q6ZMN7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms