Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARA5Q6ZMJ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms