Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A4Q6YBV0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC36A4Q6YBV0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC36A4Q6YBV0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms