Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ASCL4Q6XD76 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL4Q6XD76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms