Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA2Q6UW10 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms