Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM220Q6QAJ8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM220Q6QAJ8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms