Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFWD3Q6PCD5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD3Q6PCD5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms