Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMBQ6PCB8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMBQ6PCB8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms