Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKN3Q6P5Z2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKN3Q6P5Z2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms