Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC4Q6P2E9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC4Q6P2E9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC4Q6P2E9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms