Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAVIN1Q6NZI2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAVIN1Q6NZI2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAVIN1Q6NZI2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms